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酵素純化過程的各個階段都有其常用的分離純化方法。純化酵素的第一個步驟，從而大幅降低蛋白質藥物與疫苗生產的成本。在產業應用的層面十分廣泛。FPLC是一款靈活、直觀、可自動化的純化系統，可應用於多種生物分子，如蛋白質、抗體、多糖、肽類、寡核苷酸、複合體、病毒、疫苗及天然小分子等純化，適合分離活性物質並有利於取得單一的生物樣品，後續可應用於一般基礎科學研究(如結構、功能分析等)、檢體樣品分選(Mass、生物晶片)、生物製藥等。

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